Strukturní Proteiny Eukaryotických Chromosomů
Výzkumná oblast
Genetická informace je uložena v chromozomech, které se nacházejí v buněčném jádře. Délka molekul DNA je však 1.000-100.000krát větší než průměr jádra. Aby se miliardy bází vešly do malého jádra, histon a další proteiny asociované s chromatinem skládají DNA do kondenzovaných vláken. Komplexy SMC (Structure maintenance of chromosome) hrají klíčovou roli v tomto skládání chromatinu a ve stabilitě genomu. Jsou konzervovány od bakterií po člověka. Ve většině eukaryotických buněk jsou přítomny tři komplexy SMC: kohezin (SMC1/3), kondenzin (SMC2/4) a komplex SMC5/6. Kohesin může vytvářet chromatinové smyčky nebo držet dvě sesterské chromatidy (vlastnost nezbytná pro správnou segregaci chromozomů). Kondenzin vytváří další smyčky a kondenzuje chromatin během mitózy. Komplex SMC5/6 se podílí na opravě DNA pomocí rekombinace, na stabilitě replikační vidlice a na antivirové ochraně.
SPEC je členem skupiny:
Výzkumná témata
Studujeme sestavování a funkce chromatinových komplexů (zejména komplexu SMC5/6). Používáme kombinaci genetických (S. pombe kvasinkový model), biochemických (většinou kvasinkový dvouhybridní systém a další vazebné testy) a bioinformatických metod, abychom získali hlubší vhled do jejich vlastností. Charakterizovali jsme většinu podjednotek SMC5/6 (z různých organismů) - jejich protein-proteinové a protein-DNA interakce. Především jsme objevili několik důležitých rysů podjednotky Nse3 (non-SMC element) SMC5/6: její roli ve strukturní organizaci SMC5/6, její schopnost vázat DNA, její evoluci od bakterií k nové savčí (MAGE) proteinové super-rodině. Kromě toho jsme se podíleli na charakterizaci nového onemocnění vyznačujícího se poškozením lidských chromozomů způsobeného mutacemi Nse3.
Členové laboratoře
- Vedoucí skupiny: Jan Paleček
- Postdoci: Barbora Štefanovie, Peter Kolesár
- PhD studenti: Jitka Vaculíková, Barbora Králová, Siarhei Paliavoi, Lenka Mahrik (mateřská dovolená)
- Alumni: Marek Adamus, Marc Guerineau, Lucie Kozáková, Edit Lelkes, Lucie Vondrová, Kateřina Zabrady
