Magisterská diplomová práce

Zadání magisterské diplomové práce

K tématu diplomové práce se student*ka přihlásí na ISu (/studium/rozpisy témat) poté, co je tamtéž téma vypsáno vedoucím nebo pedagogických zástupcem oboru. Text zadání se pro účely umístění do diplomové práce generuje přímo z ISu po potvrzení tématu práce studentem*kou, vedoucím a pedagogickým zástupcem v rozpisu témat.

Povinné předměty přímo související s diplomovou prací

C9300 Diplomová práce I (BC), 5 kr, 5 h/týd, ukončení kz

C8210 Diplomová práce II (BC), 10 kr, 10 h/týd, ukončení kz

C9310 Diplomová práce III (BC), 10 kr, 10 h/týd, ukončení kz

CA340 Diplomová práce IV (BC), 25 kr, 25 h/týd, ukončení kz

Charakteristika závěrečné práce a její obhajoba

Student*ka má možnost volit si sám téma své diplomové práce i školitele z vypsaných témat (IS). Diplomová práce v rámci specializace Genomika a proteomika je práce zejména experimentální. Předmětem diplomové práce nemůže být pouhé statistické vyhodnocení výsledků získaných jinými osobami či pracovišti. Zařazení studenta do výzkumných projektů je vítáno. Diplomová práce je konána v období 4 semestrů, průběh diplomové práce je kontrolován na odborných seminářích. Práce je podána v elektronické formě.

Obhajoba diplomové práce probíhá před komisí pro státní závěrečnou zkoušku a akademickými pracovníky garantujících pracovišť a vědeckou veřejností i studenty. Každé diplomové práci je stanoven oponent*ka, sepsán oponentní posudek i posudek vedoucího diplomové práce podle stanovených kritérií. Obhajoba se skládá z prezentace uchazeče*ky, který shrne principy, metodiky i výsledky své práce, z přečtení posudků vedoucího i oponenta*ky. Uchazeč dále odpovídá na dotazy a připomínky v posudku oponenta*ky i na další dotazy z pléna. Hodnocení uchazeče*ky je stanoveno na základě bodového systému v posudcích i na průběhu vlastní obhajoby i schopnosti odpovídat na dotazy.

Příklad návrhu tématu diplomové práce

Název tématu:

Stanovení obsahu stafylokokových enterotoxinů pomocí hmotnostní spektrometrie

Zásady pro vypracování

Vývoj a zavedení metodiky stanovení stafylokokových enterotoxinů (SE) v biologických vzorcích pomocí hmotnostní spektrometrie. Stafylokokové enterotoxiny jsou významnými kontaminanty (nejen potravin) a jejich citlivé stanovení po typech (je známo více jak 10 typů SE) je zatím ve vývoji. Hledání této metody je podpořeno úsilím EU o eliminaci hrozby SE převážně pro děti a starší osoby. Práce je stavěna na známé obecné metodice stanovení proteinů pomocí MS s aplikací na složité biologické vzorky. Jde o práci, která předpokládá manuální experimentální zručnost. Základním cílem diplomové práce je návrh postupu stanovení stafylokokových enterotoxinů (SEs) ve směsi proteinů stafylokokálního sekretomu a živné půdy pomocí hmotnostní spektrometrie.

Použitá metodika

1. rešerše na téma analýzy SEs pomocí hmotnostní spektrometrie v kombinaci s metodami přípravy a separace vzorku.
2. identifikace vybraných SEs (SEB a SEH) ve vzorcích kultivačních médií pomocí kombinace separace směsi a hmotnostní spektrometrie.
3. optimalizace metody stanovení obsahu SEB a SEH ve vzorcích kultivačních médií pomocí MS s využitím vnitřního standardu (značení 18O a syntetických peptidů).
4. stanovení obsahu SEB a SEH ve vzorcích kultivačních médií pomocí MS za různých kultivačních podmínek.

Rozsah původní zprávy: minimálně 50 normostran (30 řádků na stranu, 60 znaků na řádek, řádkování 2, bez/patkový font)

Seznam doporučené odborné literatury

Boyd et al.: Trace quantitative analysis by Mass spectrometry. Willey 2008.

Vedoucí diplomové práce: doc. Mgr. Jan Havliš, Dr.

Konzultant: Mgr. Ondrej Šedo, Ph.D.

Změna vedoucího DP nebo tématu

O změně vedoucího nebo tématu DP rozhoduje ředitele ústavu např. v těchto případech:

• po hodnocení obhajoby DP stupněm nevyhovující
• v průběhu vypracovávání DP (na žádost studenta nebo vedoucího)